シラスウナギとウツボは名前が似ている上に、見た目も非常に似ており、特に全体の形が細長いので、同じ魚だと誤解されやすい。しかし、シラスウナギとウツボは同じ魚ではなく、また、目、科、属が異なるため、分類別ではかなり異なる2種の魚である。両者をよく比較してみると、両者の外観や生活環境などにも違いが見られ、これらの違いが両者を区別する鍵となり、区別するにはさまざまな点からアプローチすることができる。
1、科属区別：上ですでに紹介したように、シラスウナギとウツボの区別は比較的に大きいが、これは二者の類別が非常に明らかな違いがあるためである。このうち、シラスウナギはウナギ目ウナギ科だが、ウツボは合鰓魚目合鰓魚科と違いが顕著で、両者を混同するのは非科学的だ。
2、色の違い：タウナギとタウナギの外観の特徴もいくつかの違いがあって、比較的明らかな体現は色である。シラスウナギの背中の上端は灰色で黒く、下端は緑だった。ウツボの背中は黄褐色だった。
3、鱗の違い：タウナギとウツボの体の鱗の違いも主要な違いの一つである。シラスウナギはウロコがあり、そのウロコは目立たず、比較的細かく観察しにくいが、ウツボはウロコがない。
4、生活環境の違い：タウナギとタウナギの習性特徴にも違いがあり、この点はそれらの生活環境に現れている。シラスウナギは回遊する習性の特徴があり、海水の中で活動することもあれば、淡水の中で活動することもある。しかし、ウツボは淡水に生息しており、沼や湖、水田などでよく見られる。
5、別称の違い：タウナギとタウナギは2種類の異なる魚であるため、それらも異なる別名がある。前者には「ニホンウナギ」「アオウナギ」、後者には「リンのない御曹司」「タウナギ」という異名もある。
