カラチョウザメは我が国では非常に有名な魚であり、希少な魚だ。存在の歴史から見ると、カラチョウザメの存在期間は非常に長く、脊椎動物の中では最も古いものの一つである、数を見ると、カラチョウザメの現在の数は非常に少なくなっており、またさまざまな理由で減少している、価値を見るとカラチョウザメの価値は非常に高く、研究価値としても、薬用や観賞価値としても非常に高い。これらの原因はいずれもカラチョウザメが保護された重要な理由であり、我が国で保護動物に設定された理由の一つでもある。カラチョウザメは我が国の保護動物であるだけでなく、世界自然保護連合の絶滅危惧動物にも指定されており、保護も受けている。
カラチョウザメは保護動物として、我が国で比較的よく保護されている。例えば、カラチョウザメの狩猟は禁止されているし、カラチョウザメの食用や売買も禁止されている。しかし、現在は人工的に育成されたカラチョウザメがあり、それらは人工養殖が可能だが、関連する証明書も必要で、こうしたカラチョウザメは食用にも使用でき、比較的高い食用価値を持つ。
すでに紹介したように、カラチョウザメは我が国の保護動物であり、また我が国では最高級の保護動物、つまり1級保護動物に属する。そのため、国がカラチョウザメを保護する力は非常に強く、措置も非常に多い。現在、カラチョウザメの捕殺、売買、輸送、食用など、それらを傷つけるその他の行為はすべて違法となっている。さらに、現在も科学研究を通じてカラチョウザメの繁殖を促進し、より多くの生息数を確保しようとしている。
