ヒメダカを養殖する際には、養殖水槽の選択に注意する必要がある。全体的に見て、メダカは水槽に対する要求があまり高くないので、水族館から購入した一般的な水槽か水槽を選択して、そのような粗悪な水槽を購入しないでください。水槽の大きさに注意してください。メダカは体が大きくなく、小柄な魚なので、水槽の体積はあまり大きくありません。
ただ、養殖するメダカの数が多いとか、混養を考えるなら、もう少し体の大きい水槽を選んだほうがいいと思います。また，水槽を選択する際には，底部にV字型の導流槽を有するものを用いることが望ましく，これにより水中のゴミの一部を水流とともに持ち去り，水質を浄化することができる。また、水槽にはフィルターを1つ装備したほうがいい。また、カバーは流水式のものを使うと、水を取り替えるときに水槽の中に水をゆっくり流すことができ、水環境を大きく変えることはありません。
水槽を購入するかを考える際に重要な点の一つは水槽の大きさである。メダカは体の大きな魚ではないので、大きな水槽を買う必要はありません。しかし、それらの活性は比較的高く、水槽の中には十分な空間が必要です。そのため、比較的多くのメダカを養殖したい場合や、メダカを他の品種の魚と一緒に混養したい場合には、大きな水槽も必要です。具体的にどのくらいの大きさのかまくらを買うかは、養殖の数によって決めることができます。
