メダカは一般的には大人になってからヒメエビを食べることはありませんが、大人になってからのヒメエビは体型がメダカと似ているため、メダカはヒメエビを食べることができません。次に、ヒメエビは殻と頭部が相対的に硬く、メダカも食べられない。最後に、アカエビにはアオトングがあり、非常に激しい攻撃を受けても、彼らのアオトングが身を守るため、メダカは普通、大人のアカエビを食べることはできません。しかし、ヒメエビの卵や抜け殻しているヒメエビの場合、メダカに食べられてしまう可能性がある。幼生のヒメエビは体が小さくて反抗する能力がなく、抜け殻した時のヒメエビも自衛する能力がなく人の攻撃に任せるしかないので、幼生のヒメエビはメダカに食べられてしまう可能性があるからです。
メダカと黒殻エビは混養することができますが、メダカは一般的に上層で活働し、黒殻エビはいずれも下層で、両者は一般的な状况では出会うことができないので、一緒に混養するのに适しています。またメダカとヒメエビは水温と水質に対する要求が比較的似ており、ヒメエビは水槽内のほとんどの藻類を除去し、水質を清潔に保つのに役立っている。
ただし、メダカとヒメエビを混養する場合は水槽内に水草を植えたり、シェルターを置いたりしてヒメエビが抜け殻したときに隠れる場所を確保する必要がある。
