ワニ亀の水質に対する要求は高くなくて、彼らは比較的に皮が固くて、水質がきれいでさわやかでさえあれば、彼らはとても良い生存ができます。ワニガメはミズガメで、深水で飼うのが一般的なため、水質悪化のスピードが速くなく、週に2~3回水を入れ替えればいいというのが一般的だ。水を替えるたびに必要なのは底の糞や食べかすをきれいにしてから、半分や3分の1の水を入れればいいということです。アニガメの水質悪化が早い場合は、大きな容器に変えて飼育すればよいが、容器が大きくなると水体も大きくなり、水質悪化のスピードが遅くなるためだ。
ワニガメは川の水、湖、山の泉、水道水で飼うことができ、アニガメは野外にいる時から川の中で生活しているので、彼らはすぐに川の環境に适応することができます。しかし、河川水を使用する前に汚染の有無を確認する必要があり、不純物が多すぎる場合は使用しないことをお勧めします。湖水や山の水は汚染されにくいが、入手が難しい。便利なのは水道水だが、水道水には塩素ガスが多く含まれており、ワニガメに大きな影響を与えるため、飼育には水道水をそのまま使用することはできず、2日前に日にさらして使用する必要がある。