ドジョウもミミズも我が国に生息するありふれた動物で、分布は非常に広い。全体の形を見ると、どちらも細くて長いので、混同する人もいます。しかし、ドジョウとミミズは実際には非常に異なる動物であり、その違いは多くの点で現れている。まず、両者のクラスが異なり、かつ、その違いが非常に大きい。また、両者は外見、体型、生活環境、習性などの面で、いずれも大きな違いがあるので、両者を混ぜることはできません。
1、科属区別:前述したように、ドジョウとミミズの分類の違いは非常に大きい。具体的に見ると、ドジョウは脊索動物門の硬骨魚綱コイ目ジョウ科ドジョウ属に属し、ミミズは環動物門の寡毛綱単方向虫目の正虫科正虫属に属する。比較的大きな分類を見ると、ドジョウは脊椎動物であるのに対し、ミミズは無脊椎動物であり、非常に大きな違いがある2種の動物であることは、二者門、綱、目、さらに具体的な分類の違いからも明らかである。
2、体型の違い:ドジョウとミミズの体型の違いは大きく、両者に比べミミズの体型はドジョウよりかなり小さい。
3、ひげの違い:見た目を見ても、ドジョウとミミズには明らかな違いが多い。例えばヒゲは、ドジョウにはヒゲがありますが、ミミズにはありません。
4、食べ物の違い:習性から見て、二者の違いも比較的に大きくて、食性は違います。ドジョウは餌が多いのですが、その中には甲殻類や水生昆虫などの小型の動物や、藻類や植物くずなどの植物類があります。しかし、ミミズの餌は土壌中の有機廃棄物で、土をほぐす役割を果たす。