淡水チョウザメは偏肉食性の魚類に属し、それらの食性は比較的狭い。そしてそれらはそれぞれの段階で、食べる食べ物も異なっています。幼少期のチョウザメはいくつかのプランクトンを好んで食べ、一般的な水生オリゴ毛類、ユスリカの幼虫、枝角類、橈足類が餌となる。
大人になると、小魚、小エビ、軟体動物、貝類、カニ類、シジミ類、甲殻類など、食べられる食べ物の種類が多くなります。大人になると食べられる餌の種類は少し多くなるが、泳ぐスピードが速くなく、捕食能力も高くないため、捕まえることができる餌も限られている。また、人工養殖の場合は、ミミズやアカムシ、豊年エビなどの餌を与えることができます。彼らが正常に食事をした後、合成飼料を与えることも選択できる。
淡水チョウザメは餌の必要量がそれほど高くないので、人工養殖の場合は1日1回与えるという選択肢があり、1回の餌の量は腹8分目に抑えるのが最適です。もし生き餌を与えるのであれば、動きの遅いものを選んで捕らえるようにしたほうがいいでしょう。また、チョウザメは底生類の魚で、水底での生活を好むため、人工的に餌を与える場合は餌を沈めたものを選ぶことで餌を得ることができる。