成人以降のクロコダイルガメは冬眠できるが、原産地にいた頃は冬眠の習慣がなかったが、現在我が国の大部分の地域では冬に20℃以上に達することができず、気温が15℃を下回ると冬眠に入る。また、ワニガメは冬眠に入ることで、より良い休息を取ることができます。しかし幼少のワニガメは、抵抗力や免疫力が低く、そのまま冬眠に入ると病気になったり凍死したりする恐れがあるため、冬眠は避けたほうがいい。飼育者は冬期に入ると、加熱棒を使って水温を20℃以上に保つことで、正常に活動できるようにする必要がある。
ワニガメは冬眠に入る前に、多くの食べ物を摂ります。飼育者が冬眠に入るためには、まず栄養価の高い餌をたくさん与えなければならない。彼らが冬眠に入った後、飼育者は水位を下げる必要がある。水位の高さは腹甲くらいにしておくとよいでしょう。湿らせた砂地を用意することもできます。ワニガメは適応能力が高いが、冬眠に入る際には温度にも注意が必要だ。クロコダイルガメの冬眠時の温度は5-10℃、最低3℃を下回らないようにすると凍死のリスクがある。
