ワニガメは段階によって適している水位の深さも異なり、飼育者はその体型に合わせて水位の高さを調整することができる。もしアニガメが生まれて間もないのであれば、彼らが生活する水位の高さは彼らの背甲の高さと一致するのがベストだ。生まれて間もないため、環境への適応力や体力が劣り、深い水の中での養殖には向いていないからだ。
成人してからは、背甲の高さの2〜3倍に水位の高さを制御することができる。大人になると体力がつくし、水の中で続けられる時間も長くなるからです。大人のワニガメは3時間潜水することができる。深水飼育の方が彼らの成長・発育に有利だ。ディープウミガメではあるが、特に深い水中での活働には向かないため、最大で背甲の3倍以上の水位にならないように飼育している。
クロコダイルガメは適応能力が高く、3-45℃までの水温で生存できるが、15℃を下回ると冬眠に入る。水温が10℃を下回ると、彼らは深い冬眠に入ります。人工養殖のワニガメは、水温を20−33℃に保つことができ、条件が合えば加熱棒を使って25−28℃に保つことができる。これにより新陳代謝が上がり、成長・発育が加速します。