飼育者がワニガメに卵を産ませるには、繁殖能力のある雄ガメと雌ガメを選んで交配する。一般的に、人工養殖のワニガメは3~4年で成熟する。雄ガメと雌ガメは交尾に成功してから、卵を産むことができる。野生に生息するワニガメが卵を産むときは、広くて湿潤な土地を選び、土をかき分けて卵を産み、最後に土をかぶせて出ていく。人工繁殖の場合も、土地や砂地を用意して、中に入れて産卵させます。
このほかにも、繁殖の際には飼育者が周囲の環境を快適にし、大きな音で邪魔されないように周囲を静かにしなければなりません。
ワニガメは卵を産んだらふ化が始まり、飼育者は産んだ卵を土から取り出し、きれいに拭き取ってからふ化箱に入れる。孵化箱にバーミキュライトを入れ、水を加えて攪拌し、環境を湿潤に保つ。また、温度を30℃前後に保ち、湿度を80-85%に保つ必要がある。ふ化の期間中、飼育者は定期的に水を噴霧し、ふ化ケース内の湿度を確保する必要がある。また定期的にライトを当てて、壊れた卵が正常な卵を汚染しないようにしなければならない。
