黄頭側首亀の異なる成長段階、水位に対する要求も異なる。彼らの幼年期には、少し浅い水位が必要で、飼育者は背甲の高さに合わせて水位の高さを調整するか、1-2センチ高くすることができる。幼少期は体が小さく、体力や泳ぎが劣っていたからだ。深い水の中で飼育すると、溺死したり、むせたりすることがある。
体の大きさに応じて適応する水位の高さも比較的広く、飼育者は体の大きさに合わせて調整することができる。彼らが成人すると、水位の高さを背甲の高さの2-3倍に抑えることができる。また、ひなたぼっこが好きなので、飼育者は容器にひなたぼっこ台を作る必要があります。容器内に干し台や緩やかな傾斜があれば、飼育の水位をもう少し高くしてもいい。
黄頭側首亀の原産地は気温が高く、熱帯亀であるため、30℃以上の高温は許容できるが、20℃以下の低温は許容できない。水温が低すぎると、彼らの食欲や活動量に影響を与える。黄頭側首亀を人工飼育することで、水温を24−28℃の間に保つことができる。また、キイロハコガメは冬眠する習性がないため、冬場に入っても飼育者は加熱棒を使って水温を20℃以上に保つ必要がある。