草亀は繁殖穴を見ることによって雄と雌を区別するのが最も正しい。雄のソウガメの放殖孔は尾部にあり、腹甲後縁から遠く、長方形の形状をしていた。雌クサガメの放殖孔は腹甲の後縁部に比較的近く、形状は円形であった。排水孔を観察することにより、最も速く、最も直感的に雄雌を識別することができ、しかもその精度は非常に高い。
1、尻尾を見る：草亀は尻尾を見ることで雄雌を区別することができ、雄草亀の尻尾は雌草亀の尻尾より長くて細く、尻尾の根元が太く、鋭角の三角形を呈する。雄ガメの肛門は尻尾の付け根から比較的離れており、腹甲の2枚の肛門に形成される欠刻は浅く、欠刻の角度も大きい。母クサガメの尾は短くて筋状であり、腹甲の2枚の肛門盾に形成された欠刻は比較的深く、欠刻の角度も比較的小さい。
2、腹甲を見る：亀を裏返して、腹甲を触る。腹甲が内側に凹んでいるのが雄、腹甲が平らにそろっているのが雌。また、雄のソウガメの腹部の模様は比較的薄く、雌のガメの腹部の模様は密集していた。
3、背中甲を見る：背中甲を直接観察することもできる。背甲が短く、幅が広いのが母クサガメ。背甲が長くて狭いのがオスの草亀。
