マスカガメは成体になると溺死しなくなりますが、野外にいるときから深い水の中で生活し、泳ぐ能力が高いため、家庭で飼育すると一般的にはあまり深い水位にならないので、一般的には溺死しません。しかし、生まれたばかりのジャコウガメは水位の深い場所に置いておくと溺れてしまう。体が小さく、呼吸のために泳いで水面に来るのを支える体力がないため、むせることや溺れることがある。
ジャコウガメは深水ガメに属し、比較的深い水中に生息するが、人工養殖では水位を制御することができる。特に幼生のジャコウガメは水位が少し低く、5~10センチに抑えたほうがいいという。大人になってからのジャコウガメは水位を20~30センチに調整することができるが、長時間水中にいることもできず、毎日水面に上がって日向ぼっこをする必要があるため、飼育者は容器の中に干し台を設けて、彼らに休息の場を与えたほうがよい。冬になると、ジャコウガメは冬眠に入りますが、この時の水位は深すぎてはいけません。ただ湿潤な環境を提供すればいいだけです。冬眠中は活動しないので、水位が深すぎるとダメージを与えてしまいます。