異性のワニガメ2匹なら、一緒に飼うこともできる。雄と雌が1人になるとけんかが減るためだが、飼育者も体型の差が大きくならないように注意する必要があり、そうしないとけんかになることもあるという。雄と雌が普段一緒に飼っているとけんかになる場合は、発情期に一緒に飼ってみたり、交尾してから離れないようにしてお互いの存在に慣れさせたりすることで、けんかを減らすこともできます。
ただしオスのワニガメ2匹を一緒に飼うことはお勧めできませんオスのワニガメはどちらも縄張り意識が強く、また性格が獰猛なので、一緒に飼うと争いになることが多いからです。さらにアニガメは大人になると体が大きくなり、2匹を一緒に飼うには大きな容器が必要になる。
ワニガメは他のカメと一緒に飼うことはできません。性格が獰猛で、肉食動物なので、他のカメと一緒に飼うと他のカメを攻撃しやすく、ひどい場合は他のカメを食べてしまうこともあります。またワニガメは深水ガメであり、よく見られるカメは浅水ガメや半水ガメであり、ワニガメと混養するのには不向きである。ワニガメは成体になると40センチ以上になるが、普通のカメはせいぜい20~30センチ程度と体型の差が大きく、一緒に混養するのにも向かない。
