一般的に、ブラジルガメには細菌がいて抵抗力が弱い人に感染することがあります。よく見られる病気は比較的多く、例えば、水カビ病、腐甲など、一般的に多くの細菌を病みカメに持っています。そして病気のないカメでも、体には細菌がついていることがあります。たとえば飼育経験が豊富な人なら誰もが知っているサルモネラ菌。
カメ自身の抵抗力は非常に強く、何の問題もありませんが、この細菌は体の抵抗力が比較的弱い人にとっては、感染すると自分自身の健康に非常に影響することがあります。この菌は成体のカメでは少し少なく、幼体のブラジルガメでは最も多い。だから日常的に飼育している間は、安易に子ガメに触れないようにしましょう。どうしても触れるなら手袋をしたほうがいい。手袋がない場合は、接触後にこまめに手を洗い、個人の衛生状態に注意してください。
一般的にブラジルガメに付着した細菌を処理する方法には、生理食塩水で洗い流す方法と、水の温度を上げる方法があります。生理食塩水で洗い流すのは毎日ではなく、基本的には1週間に1回か半月に1回。注意すべきは、生理食塩水で洗い流した後は必ず水で洗い流すことです。水温が上がることで、ある程度殺菌もできるので、多くの細菌は高温では生きられません。ただし、温度が高すぎないように注意してください。そうしないと、ブラジルガメの健康に影響します。また、ブラジルガメは普段から日光浴をしておくと殺菌にもなります。
