池で水草を栽培するメリットは多く、水質を改善するだけでなく、魚の餌としても利用でき、藻類の爆発を予防することができる。水草は必ず底泥に植えなければならず、栽培密度もあまり高くならないことに注意しなければならない。そうしないと、魚と水中の酸素を奪い合い、後者の生存に影響を与えることもある。
池が完全に日光にさらされると、十分な光が藻類の大量繁殖を招きやすく、水質に影響を与え、水体が濁ってしまうことに注意する。このような情況に対して、好適に遮光することができ、遮光は爆発藻を予防することができるだけではなく、同時に水温の上昇による溶存酸素量の低下を避けることができ、水体の酸欠を予防する
養魚池の水の濁りは、藻類だけでなく、微生物の繁殖が多すぎる場合もあります。微生物が大量に繁殖できるのは、養魚池に十分な養分があるからです。養分の源は魚食や肥料などです。給餌を減らすことで、水質を改善することができます。それによって水体がきれいになります。
薬物治療は二種類に分けられ、一つはシリンダー内の菌類に対して、一般的に殺菌能力の強い薬、例えば二酸化塩素などを選択する。もう一つは池の中の藻類に対して、通常は各種の除藻剤を使用しています。除藻剤は必ず使用量に注意しなければなりません。そうしないと、池内の他の生物にも悪影響を与えます。