魚池の魚が死んだら、生石灰で消毒することができますが、そのほかに、漂白粉や二酸化塩素も良いですが、いずれも大量の細菌・真菌を退治できます。注意しなければならないのは、死んだ魚が必ずしも水中の細菌によるものではなく、水質や水温の変動、あるいは酸欠などが原因の可能性もあるため、むやみに消毒せず、まず水質を測って、何が問題なのかを見てから、対症療法を行うことだ。
1、気温異常：魚が死んでしまうのは、まず気温異常のせいかもしれない。温度が大きく変化しているため、中上層の魚も下層に行ってしまう。こうすると下の魚が密集しすぎて、問題が発生しやすい。このような場合に備えて、水位を増やすことができます。水深が深くなれば、魚もそれほど密集しなくなります。
2、水質が悪い：長期的に水質が悪いと魚が死ぬこともある。魚池にしても、定期的に水を入れ替えて水を加えることで、水質を改善することができる。注意したいのは、普段から餌やりを控えること、不規則に餌をやりすぎることが、水質悪化の要因になることです。
3、深刻な酸欠：もし水が深刻な酸欠になれば、魚も死んでしまう。これは通常、高温の季節に起こりやすいが、高温になると溶存酸素が低下し、他の手段で酸素を打たないと魚は酸素が不足するため、大型の酸素補給ポンプを用意して酸素を補給する。
