ドジョウとウツボは我が国ではよく見られる動物で、顔も似ているので、混同されやすい。しかし、実はドジョウとウツボは同じではありません。最も重要な違いは二者の所属する類別が違うことで、その上差異は比較的に大きいので、二者も非常に親密な類縁関係がないことを物語っている。また、見た目や分布地域、呼吸の仕方にも違いがあるので、区別するには様々な面から行うことができる。
1、科属区別：上ですでに紹介したように、ドジョウとウツボの重要な区別の一つは所属する類別の違いであり、これこそ二者が異なる二種類の動物であることを決定した。具体的には、ドジョウはコイ目ジョウ科ドジョウ属に属するが、ウツボは合エラ目合エラ科ウツボ属に属する。二者の目、科、属はすべて異なっており、その差は比較的大きく、類縁関係もそれほど親しくないことがわかる。
2.見た目の違い：全体的に見れば、ドジョウとウツボは似ているが、よく見ると多くの違いが見られる。まず、両者の頭部に違いがあり、ドジョウはウツボよりも頭部が小さい。両者のひげにも違いがあり、ドジョウにはひげがあるが、ウツボにはひげがない。両者の尻尾にも違いがあり、ドジョウの尻尾は幅のある形をしているが、ウツボの尻尾は尖っている。
3.分布地域の違い：ドジョウとウツボの分布地域にも違いがある。これに比べて、ドジョウは我が国に広く分布している。
4、呼吸方式の違い：ドジョウとタウナギは呼吸する時に使う呼吸器官が同じではない。前者はエラと腸、後者はエラと口、そして皮膚を使っている。
