水槽内の褐藻を苔にするには、まず褐藻を取り除いてから苔を育て直すこと。褐藻類の除去には殺菌灯や除藻剤などを使用すれば藻類を速やかに死滅させることができるが、再生を防ぐためには水槽の物理的ろ過を強化して苔の栽培を容易にすることが望ましい。苔の成長には一定の光が必要で、普段は水槽の中に有機物を存在させることができますが、あまり多く入れてはいけません。
1、人為的な掃除：褐藻を掃除することができますまず人為的に掃除して、水槽の中の魚をすくって、そして中の水を入れて、それから柔らかい布で藻類を拭き取って、もし付着した比較的に丈夫で、必要な掻き取り刀でそれをそぎ落として、しかし気をつけてガラスを傷つけないようにします。
2、生物のクリーンアップ：生物のクリーンアップは主に2つに分けて、1つは善玉菌、例えば硝化細菌、それは褐藻を退治することはできませんが、水中のアンモニア性窒素を吸収することができて、アンモニア性窒素の含有量が低くなって、褐藻も少なくなりました。もう1つは藻を食べる生き物で、例えば、クロコダイルエビ、ツルガイ、藻を食べる魚などです。
3、薬物クリーンアップ：薬物クリーンアップは除藻剤を用いて、よくあるのはグルタルアルデヒド、硫酸銅などがあるが、注意して混用してはいけない、両者は反応して、それによって除藻の効能を失うことができる。また、除藻剤は藻を除去するだけでなく、予防の役割も果たすことができる。
