水質が良くて普通緑藻が生える。褐藻類は通常、水槽の初期に形成され、主にアンモニア性窒素を好むと同時に、光に対する需要が高くなく、この頃の水はまだ魚を飼うのにあまり適していない。しかし、時間の経過とともに褐藻類は減少し、水中のアンモニア性窒素はすべて硝酸塩に変換されるので、褐藻類の成長は停止し、緑藻はまだ始まったばかりである。
1、色：褐藻と緑藻の第一の区別はそれらの色です。通常、褐藻は褐色で、緑藻は緑色である。ただし、この場合には例外があり、褐藻が十分に光の当たる環境にいると緑色に変色しますが、緑藻は通常変色しません。
2、生育環境：褐藻と緑藻の生育環境も異なる。いずれも水中にあるが、水質には大きな差がある。褐藻類は、アンモニア性窒素の含有量が多い水域で生育することができ、硝化細菌によってアンモニア性窒素が変換されると死滅する。一方、緑藻はアンモニア性窒素が少なく、硝酸塩の含有量が高い場所での生存に適している。
3、作用：褐藻と緑藻は水槽水に対する作用も異なる。褐藻類は有害とされているが、数が多くない限り水質への影響も少なく、アンモニア態窒素の吸収を助けるが、他の藻類の成長を抑制する。緑藻は水槽の水、特に生態循環を維持する上でより有益である。
