1、排殖孔の区別:黄耳亀の年齢がまだ小さい時、雄亀か雌亀かの区別があまり容易ではない。大人になると区別がつきやすくなり、区別の特徴が明らかになります。まず、それらの排出孔の位置から区別することができます。雄の黄耳亀の排植孔の位置は尾に近いが、母の黄耳亀は逆に尾から遠い。
2、尾の違い:雄亀と母亀の尾にも違いがあり、主に大きさに表れています。雄亀の尾は太くて大きいが、雌亀の尾は短く、観察しやすい。
3、体型別:雄亀と雌亀の年齢が一致すれば、それらの体型から区別できる。同じ年齢のウミガメで、体の大きいものは母ガメ、体の小さいものは公ガメが一般的です。大人になってからもそうです
黄耳亀公母は一緒に混養することができて、一般的に衝突することはありません。黄耳亀は活性の高い亀で、普段は活動時間が長いので、混養するには十分な空間を提供する必要があり、よりよく活動することができます。また、餌やりにも特に注意が必要で、混養すると餌の量を増やす必要があります。そうしないと、黄耳亀は餌を奪うときに衝突しやすくなります。混養の際には、ケンカになるかどうかをよく観察し、ケンカがあればすぐに分けることもできます。