ワニは性成熟した後、適切な繁殖時期に交尾して卵を産む。一般的には、毎年12月から3月にかけて、ワニの繁殖のピークです。交尾の過程は水中で行われます。オスのワニはまずほえるなどしてメスに求愛し、メスに近づいて陰茎で交尾します。交尾後10日ほどでメスが卵を産みます。卵を産む過程は地面で行われ、メスは卵を産む前に地面に穴を掘ってから卵を中に産んだ。ワニの卵の孵化も土坑の中でできました。
上で紹介しましたが、メスのワニは卵を産む前に穴を掘り、穴の中で卵を産みます。ワニの卵の孵化過程も穴の中で完成した。自然孵化に必要な時間は比較的長く、一般的には少なくとも2ヶ月、時には3ヶ月かかることもある。孵化までの時間は長いですが、メスのワニは隣で守っていて、小さなワニの声が聞こえるまで待っています。メスのワニは小さなワニを助けて土坑を出て、繁殖の過程を終えます。ただし，自然孵化の成功率は特に高くなく，40%前後であった。
人工孵化なら時間短縮ができ、孵化の成功率も高く、90%程度になることもある。人工孵化の際、温度と湿度を制御することは2つの重要な任務である。特に温度は適温で孵化時間を短縮できる。また、具体的な温度は孵化したワニの雌雄にも影響します。温度が28~31度なら、孵化したのはメスです。31度以上の孵化で、孵化したのは雄だ。また、人工孵化の際には位置も重要で、卵の中のワニは位置の変化に敏感である。孵化の過程で、それらの位置を大きく変えることはできません。
