公彩虹鮫と母彩虹鮫の違いはそれほど大きくないため、見分けには一定の難しさがあり、外見から見分けることが多い。具体的には、以下のような判別方法があります。
1、外観から見ると、雄の虹鮫の体は小さく見えますが、雌の虹鮫の体は大きく見えます。
2、腹部の体勢を見ると、性的に成熟すると、母の虹鮫の腹部は肥大しているように見えますが、公の虹鮫は細長いです。
3、体色を見ると、雄の虹鮫の尾の色は主に金紅色で、雌の虹鮫の尾の色は主にオレンジ色です。
4、性格的にはオスの方が短気で、メスの方が穏やかな性格になります。
虹鮫公母は一緒に飼うことができます。レインボーザメは「一夫一妻」の原則を守っているので、普段の生活の中で、公母を混養することができ、自然繁殖させることもできます。しかし、混養の過程でも養殖密度に注意する必要があり、繁殖期には雄魚1匹1匹を出して単独で繁殖することができ、そうしないと雄魚と雄魚の間でケンカが起こりやすく、死傷者が出やすい。