レインボーサメは基本的にいろいろな小型魚と混養できますが、神仙魚とは混養しないほうがいいです。大人になると、神仙魚を傷つけやすいからです。同類の魚にも敵意があるので、養殖の過程で同類との混居を避けるようにしなければならない。1つのかめの中で虹鮫をあまり飼わないほうがいいです。1~2匹飼ってもいいです。
養殖の際は数と体型の組み合わせに注意し、実際の養殖密度は大きすぎてはいけません。地図魚や竜魚など、あまり体型の違う魚と混養しないほうがいいです。
レインボーサメとシマウマは混養できます。まずレインボーサメはほとんどの小型魚と混養することができます。同類の魚以外のタイプの魚には攻撃的ではないからです。そして2種類の魚全体の習性から、比較的似ていると考えられています。これらは同様に24−28℃程度の水中生存に適しており,水質に対する要求はそれほど厳しくない。食事的にはミミズや赤虫などの餌を食べることができます。ただし養殖中は養殖密度に注意する必要があり、レインボーサメはシマウマよりも体が大きいため、混養中はレインボーサメを1~2匹飼えばよい。