スカタール亀の性別の特徴は明らかではなく、外形から見るだけで、ほとんど同じだ。体が小さく、腹甲の長さが10センチあるカメは、腹甲の甲片の形で大きく分けることができ、肛門の近くに2枚の甲片があり、この2枚の甲片の先端が内向きであれば、一般的には雌亀である。この二つの甲片の先端が外向きであれば、一般的には雄亀である。
体型がもう少し大きいカメは、尾と腹甲の形態で区別することができます。通常、尾が太く、体型が大きく、腹甲に凹みがあるのは雄です。尾が細く、体が小さく、腹甲が滑らかなのはメスです。
性別の違うスカタールカメは一緒に飼ってもいいです。攻撃性が強く、特にオスのカメは幼亀の時期から攻撃性があり、他の品種のカメと一緒に混養しないほうがいい。同じ品種のカメについては、体の大きさに相当する雌のカメを一緒に飼うことができますが、養護期間中はお互いに傷つけないかどうかを観察し、上記の行為があれば、別々に飼うことをお勧めします。