三湖慈鯛が繁殖できる品種はたくさんあり、品種によって性成熟の時間が同じになることはありません。通常、養殖から1~2年後には、三湖慈鯛の幼魚が性成熟し、繁殖能力を備えている。しかし、具体的な時間は品種によって異なります。一部の品種は成長速度が速く、1年もかからずに性成熟することができる。一部の品種は成長速度が遅く、成長に2年以上かかると機能的に成熟する。
三湖慈鯛の繁殖シーズンは春と秋です。通常、性成熟した成魚は年に2回繁殖することができる。しかし、この法則はすべての品種に適用されるわけではない。一部の品種は年に一度しか繁殖できない。繁殖頻度が高く、年に4回以上繁殖できる品種もある。30~40日ごとに繁殖できる品種もある。
三湖慈鯛には主に2つの繁殖方式があり、それぞれ基質繁殖と口孵化繁殖である。貝や岩穴に卵を産みつけ、親魚がそばで保護する繁殖方式は基質繁殖である。母魚は受精卵を口に含んで保護し、徐々に孵化させ、孵化してから幼魚を放出する繁殖方式が口孵化繁殖である。