大部分の藻類は光を好むため、成長過程に十分な光が欠かせないため、水槽の爆発藻はまず光照射の十分な環境が必要である。水槽が暗い場所に置かれていて、普段は直射光がないと、藻が爆発する可能性は大幅に低くなります。
藻類の成長にも一定の養分が必要であり、そのため、水体富養の時だけ藻の爆発現象が現れ、もし水中の有機物とアンモニア性窒素の含有量が比較的に低く、藻類は養分が不足し、大量に繁殖することができない。水体の栄養を高めるには、普段から餌をたくさん与えればいいのです。
一般的に水草のある水槽では藻が爆発することは少ないが、これは水草の成長が一定の成長空間を占めていると同時に、水中の養分も吸収しているため、藻が成長できなくなっている。そのため、藻の爆発を防ぐためには、水槽の中に一定数の水草を植えることができます。
水草のほか、水中の善玉菌、特に硝化細菌が藻類の爆発を抑える働きをする。アンモニア窒素を亜硝酸塩と硝酸塩に変えることができ、藻類も一定の栄養を失うことができます。藻類の爆発は、水槽の硝化システムが確立されていないことを示している。