クサガメ苗の水深は具体的な数値がなく、飼育者はその体型に応じて深さを決定する必要がある。一般的に、亀苗の水位は背甲以下が望ましいとされている。生まれて間もないため、体力や泳ぎが劣り、環境への適応力も劣るからだ。飼育者は水位を背甲以下に制御することで、彼らが正常な活働と呼吸ができることを保証し、むせることや溺死の状況を避けることができる。体の大きさが増えれば、飼育の水位も少し上げることができる。これらが成長して成熟すると、水位の高さは背甲の高さの1−2倍、最高で2倍を超えないように制御できる。
すでに述べたように、ソウガメは純水ガメではなく、深い水の中で生活するのに適しているわけではありません。しかも肺で呼吸をしているので、定期的に水面に浮いて換気をする必要があります。その上、ソウガメは水に弱いため、飼育されている水位が深すぎると、水につかることができず、溺死してしまうこともある。
飼育者がクサガメを深い水で飼育するには、容器の中に干し台や緩やかな傾斜を設け、自分で生活する水位の高さを選べるようにする。また、草亀も長期間水中で生活することができず、毎日岸に登って日向ぼっこをしなければならない。
