クサガメを飼う水深をどのくらいにするかは、体の大きさや成長の段階によって決める必要があります。一般的に、幼生の草亀は体が小さく、また、水も泳ぐ能力も十分に発達していないため、飼育する水位をあまり深くすることはできません。頭を上げたりつま先立ちをしたりすると新鮮な空気が吸えるように、背中の甲より下におさえるのがベストです。成長して1~2年後には環境への適応力も強くなり、飼育者は水位の深さを上げることができるようになる。水位の高さは背甲より1〜2cm高くなるように制御する。成長したら、水位の深さをもう少し上げることができます。すでに成人し、体も体力も発達しているため、背甲よりも1倍高い水位で飼育することができる。
草亀は水質には要求されず、水道水、川の水、湖、井戸水でも構いません。一般的で入手しやすいのは水道水で、この水の水質は比較的きれいだが、化学殺菌と消毒を経て、水中の塩素ガスは草亀の健康に一定の影響を与えるため、飼育者は使用前に2-3日前に日焼けする必要がある。
川の水や湖の水は、草亀が生息するのに適した水である。なぜなら、この水は原産地の水と比較的似ているからである。しかしこの2種類の水は汚染されやすく、また水質は比較的不潔なため、飼育者は使用前に不純物をろ過する必要がある。
