草亀は深水で飼うことができません。草亀は深水亀には属さず、深水での活動を好まないからだ。しかも生まれてからの期間が短く、体力も泳ぐ能力もまだ発達していない。下手に深水で養殖すると、むせたり溺れたりする恐れがある。コガメの水位は背甲以下に抑えると、生息環境が湿潤で、正常な呼吸に支障をきたさないことが望ましい。
大人になってからの草亀も、あまり深い水中で飼育することはできず、水回りも泳ぎもよくないので、水位の高さは20~30センチ程度に抑えておけばよいとされています。干し台や緩やかな斜面を作っている場合は、水位を相対的に深くすることができますが、最高で40センチを超えないようにしてください。
コクガメは冷水で飼えません、彼らは生まれて間もないので、環境への适応能力が劣っています。冷水で飼育すると、風邪やその他の不快感を引き起こす可能性があります。しかも低い水温は彼らの食欲や活動量に影響を与え、長期の低温は彼らの成長・発育の速度にも影響を与える。
コクガメは生まれて間もないので、飼育者は水温を25℃前後に保つのが望ましい。条件があれば、加熱棒を取り付けて水温を常に25℃に保つことができます。