クロコダイルガメを深水で飼うことができるかどうかは、体の大きさによって決める必要があります。それぞれの段階で適応する水位も異なるからだ。一般的に、幼少期のワニガメは深水での生活には向かないとされている。生まれて間もないので体力も泳ぐ能力も低く、下手に深水で養殖すると、むせることや溺死するリスクが出てくるからだ。ですから幼少期のワニガメは水位の高さと背甲の高さが一致していることが望ましいのです。
しかし、成体になると、深い水の中で養殖することができます。成体になると環境への適応力が強くなり、体力も水泳能力も向上し、深水養殖は背甲羅の発達もよくなるからだ。成体になれば深層水で養殖することができるが、水位の高さが背甲の3〜4倍以上にならないと溺死することもある。
クロコダイルガメは冷水養生が可能であり、環境に対する要求は高くなく、温度に対する要求も高くなく、3−45℃の間の水温で生存することができる。しかし水温が低すぎると食欲や活動量が減少し、15℃を下回ると冬眠に入る。ワニガメは冬眠に入ると成長が止まり、また長期間低温になったり冬眠に入ったりすると健康にも影響するため、飼育者には水温を20-33℃に保つことが推奨されている。