ピエロ魚はゼブラフィッシュと一緒に飼育できないが、これには主に2つの原因がある。まず、最も重要なのは、彼らの生息環境が異なることだ。ピエロ魚は海中に生息しており、塩の濃度が比較的高い。一方、ゼブラフィッシュは淡水魚なので、飼育している水に塩分が多く含まれていると、体内の水と塩のバランスが悪くなり、成長できなくなったり、病気で死んだりすることもあります。
次に性格的な理由ですが、ピエロフィッシュは気性が荒く、縄張り意識が強いとされています。一方、ゼブラフィッシュは温和で、他の魚を積極的に攻撃することはありません。体の大きさがあまり変わらないピエロとゼブラフィッシュを一緒に飼うと、ピエロがゼブラフィッシュをいじめたり食べ物を強くしたりして、ゼブラフィッシュの成長に影響を与えます。
ピエロ魚は小型のスズメダイやハゼ類のエビと一緒に飼育することができます。これらの魚たちは気性の差があまりなく、一緒に飼育していれば、けんかをすることはめったにありません。養魚の際には、自由に泳げるように十分な大きさの水槽を設ける。餌を与えるときは、複数の餌を与え、かつ与える量が多すぎないようにする。これにより、十分な栄養を補給することができ、水質汚染を回避することができる。新しい魚を水槽に入れるときは、ウイルスを水槽に持ち込んで他の魚に感染させないように検査します。