マスカガメは深水亀であるが、これは主に深い水中に生息できるからである。彼らが生息できる場所はたくさんあります。野外には彼らの姿があり、水槽の中にも彼らの姿がある。野外では一般的に水深の深い場所で生活することができ、長期間の野外生活で体の抵抗力は比較的強い。
ただし家庭での飼育では水位が高くなりすぎないように注意が必要で、特に幼少状態のジャコウガメを比較的水位の高い場所で飼育すると、あちこち泳ぎ回ってイライラしてしまいます。飼育の水位は一般的に体の高さの4倍程度に抑えられており、年齢とともに徐々に水位を上げていくことができる。
マスカガメは深水に長く住めず、肺呼吸をする爬虫類である。肺呼吸をしている動物は、水中で長時間生活することができず、生活時間が長くなると窒息することがあります。飼育する際には、水にプラットフォームを追加して、日なたぼっこのために常に水面に登っていることができるようにする必要があります。日光浴をよくすると体内のカルシウムの吸収が促進され、彼らの成長と発育に役立ちます。