リュウグウノツカイがミズカビ病にかかる原因はいくつかありますが、比較的よくあるのが、リュウグウノツカイが輸送中やけんか中に外傷を受け、治療が遅れたことによる細菌感染です。周囲の環境が急に大きく変化したことでリュウグウノツカイの抵抗力が急激に低下し、ミズカビに付け入る隙ができた可能性もある。また、水質が悪すぎて、水カビが大量に発生している可能性もある。
リュウグウノツカイはミズカビ病になると、前期の症状があまりはっきりせず、魚体に白い点が点在しているだけなので、よく見ないとなかなか見えません。中期になると、白い点が広がって白斑になり、しかも白斑に白い綿状のものができます。後期がひどい場合は、白斑がただれます。
リュウキュウミズカビ病がひどくならない場合の最良の治療法は、まず水を替え、塩を加え、温めることで、リュウキュウミズカビ病がひどくならなければ、数日で治ります。前期は薬の使用は推奨されていませんが、使用する薬が多すぎるとリュウグウノツカイに耐性がつくためです。中期になると、飼育者は0.04%の食塩と0.04%の重曹を混ぜて水槽内にかけることができる。連日、綿状のものがはがれていきます。後期になると、飼育者は赤血球やヨード酒で患部を塗り、過マンガン酸カリウム溶液やホルマリン薬浴をする必要がある。
リュウキュウミズカビ病治療期間中、飼育者はろ過と餌やりを中止し、さらに水温を30℃に保つ必要がある。水質が汚れていない限り、なるべく水を替えないようにしましょう。