クロコダイルガメは性成熟期に入ってから繁殖できる。交尾が完了すると、精子と卵細胞が結合して受精卵となり、最終的に雌のワニガメが卵を産み、産卵のプロセスが完了する。しかし、地域によって卵を産む時期に違いがあります。例えばの産地では4~11月に卵を産むが、我が国では5~8月に繁殖期がある。家庭での飼育では、育った場所から、いつ卵を産むかを判断することができます。一般的に南に行くほど気温が高くなり、産卵期が早くなります。
ワニガメが産んだ卵を放っておいてそのまま孵化させると、孵化率は格段に低く、孵化までの時間も比較的長くなる。そのためには人工孵化の補助が必要であり、人工孵化の際には湿潤な環境と適温を与える必要がある。一般的に湿度が80~85%の間で制御されている。カメの卵の上と下にタオルを敷くと、水分補給がしやすくなります。一般的に制御温度は20℃以上、かつ30℃前後がベストです。温度が低すぎると、彼らの孵化時間や孵化率に影響する。ふ化プールを水中に置くことで、安定した温度を保つことができます。こうしてしばらくすると、カメの卵から子カメが孵化することに成功する。