人間に比べて金魚は比較的弱い。病気になってから治療を怠ると、突然死してしまいます。一般的によく見られる病気には、魚コレラ、白雲病、腐皮病、爛尾病などがありますが、母体が生まれた時から遺伝するものもあります。この病気は小さな金魚では発見されにくいことが多く、発見されたらすでに末期なので、小さな金魚は突然死したように感じてしまいます。
死んだのは、小さな金魚を飼育していた水質が劣化していたか、汚染が進んでいた可能性もある。水質の変化は、小金魚が最も多く死ぬ原因となっている。生まれたばかりの小さな金魚は水槽に入れて飼育するのが一般的だが、水質が悪くなると水槽1つで死んでしまう。また、水の交換頻度が低かったため溶存酸素量が低く、呼吸器系の発達が不十分だったために死んだ可能性もあるという。
小金魚が死んだらまず川に戻すことができて、それらを故郷に戻すことができて、また川の生態循環を完成することができます。埋めて小金魚を自然に戻し、植物に養分を与えることもできる。火葬は環境を汚染するのでお勧めしません。他の子猫や子犬に与えることもお勧めできません。もし金魚が病気で死んでしまうと、他の小動物が死体を食べても同じ病気にかかる可能性が高いからです。