メダカはゼブラフィッシュ、シラウオ、カダヤシなどと混養することができますが、まずこれらの魚は小型の魚で、メダカとは体型が似ているので、体型の違いが大きすぎて現れる争いやケガはしません。次に、これらの魚も温和な性格の魚なので、一般的には他の魚を攻撃することはありません。最後に、これらの魚は適応能力が高いので、メダカと一緒に飼うのに適している。メダカは適応能力が高く、0−30℃の水温を許容できるが、最適な水温は23−27℃であり、水質に対する要求は高くなく、飼育者は習性に応じて混養魚を選択することができる。
1、空間:メダカは活性の高い魚であり、飼育者は普段の養殖過程で十分な空間を与えなければならない。他の魚と一緒に飼う場合、飼育者は密度を減らして、縄張り争いをしないようにしなければならない。
2、給餌:メダカは摂食能力が弱く、他の魚と混養する際には飼育者が別々に給餌することでメダカの餌を十分に確保することができる。
3、環境の安定:普段の養殖の過程で、飼育者は環境の安定を保証しなければならない。メダカは環境の変動に敏感で、水温や水質が少し変化すると彼らの不快感を引き起こすからである。