メダカは大人になってから繁殖を行うことができます。普通は4~6カ月ほどで成体になるが、成体になる時期は飼育環境やメダカの体質にもよりますが、飼育環境がよければ4カ月ほどで成体になるとされています。飼育環境が劣ると、彼らは成人するまでに6カ月かかる。
飼育環境が劣ると、まだまだ病気になりやすく、病気の頻度が高くなって寿命に影響します。飼育者が早く繁殖させようとすると水温や水質を安定させることができ、適応力は高いものの、環境の変化に敏感になるため、普段から周囲を安定させておく必要がある。
メダカが繁殖すると雄の腹びれがくっきり黒くなり、頭頂部の両目の間に黒い線ができ、しかも縄張りを張っているので、発情していない雌の場合は縄張りの雄を追い出し、すでに卵を宿している雌の場合は前に出て交尾する。雌は約2~3日に1回、1回に10~20粒産卵し、魚卵は約8~14日でふ化する。生まれた卵の直径は約0・1センチで、ふ化した小魚の体長は0・3センチだった。