ジャコウガメは成人してから繁殖できるが、性別によって成熟の時間も異なる。オスのジャコウガメのように、一般的には4~8年かかり、メスの場合はさらに長く、約5~9年かかる。しかし同性同士でも、生活している環境が違えば、それらが成熟するまでの時間は異なります。だから飼育者も彼らの体型から判断することができ、一般的な体型の長さが10-14センチの場合、繁殖能力を備えていることになる。
ジャコウガメは発育成熟後に繁殖し、彼らは水温22-26℃の間で交尾を開始する。ジャコウガメ交尾は水中で行われ、オスはメスを追いかけ続け、しばらく追いかけた後、メスが止まるとオスは素早くメスの背中によじ登り、メスのはみ出し穴に受け渡し器を入れる。交尾すると時間をおいて産卵しますが、産卵時にオスはメスと一緒に巣を作り、岸に近い場所に穴を掘って中に卵を産むことを選んでいます。家庭で飼育する場合は卵を産む容器を用意し、その中に直接卵を産み付けさせ、容器内の温度や湿度をコントロールしてふ化を待つ。周囲の環境が良ければ、赤ちゃんガメは60~84日後に殻を破って出てくる。
