塩を使用して錦鯉の黒斑病を治療するのはあまり良い効果がありません。黒斑病は主に水質の悪さや酸欠が原因なので、黒斑病を治すにはまず水質を改善する必要があります。水に塩を加えることで浸透圧を変えることができ、細菌の成長を抑制する効果はあるが、直接的な治療にはならない。
錦鯉が黒斑病を患った後、まず金魚鉢に対して消毒を行うことができて、錦鯉を先にすくって、金魚鉢内をきれいにした後に入れます。それから水槽内のろ過システムをきれいに洗浄しなければならない。きれいに洗浄した後、硫酸溶液を使って消毒することができる。
ニシキゴイの黒斑病がひどくなければ、温度差を利用して治療することができます。飼育者は加熱棒を使って温度を上げ、その後加熱棒を閉じ、温度が下がったら再び上げることを何度か繰り返すことで、黒斑病を効果的に治療することができる。しかし温度差の変化は、ニシキゴイの具体的な状況によって決める必要があります。過マンガン酸カリウム溶液の薬剤浴を1日1回、1回30分間の薬剤浴で使用することも可能である。治療期間中はできるだけ多くのニシキゴイに日光浴をし、ふんの掃除も怠らず、できれば毎日3分の1の水を交換し、1週間ほど続ければ完治する。