ワニガメはずっと水の中にいてもいいですが、自分自身がミズガメなので、野外にいるときは繁殖以外はほとんど岸に上がってこないので、ずっと水の中にいても健康に影響はありません。だが家庭でのアコガメ飼育は、水の中で長く暮らさないように干し台を作ったほうがいい。
日光を浴びることでビタミンDの合成が促進され、背中甲の細菌のほとんどを死滅させることができるからです。しかし、ワニガメは他の浅瀬ガメと違って、水から離れる時間が長くてはならないので、日光浴の時間は1時間を超えないようにしなければ、脱水状態になることがあります。
ワニガメは3日に1回水を入れ替えるのが一般的ですが、ワニガメを飼育する容器が大きく水位も深い場合は1週間に1回入れ替えることができます。ろ過システムがあれば、水交換の頻度をもう少し下げることができます。しかし、具体的には水質の状況に応じて決めることになり、水質の悪化が早く、酸っぱいにおいがする水であれば、すぐに水を交換する必要があります。水質がきれいですっきりしていれば、水を入れ替える期間を数日延ばすことができる。浅瀬でワニガメを飼育している場合は、水をすべて入れ替える。深水飼育であれば、半分や3分の1に交換することができます。
