草亀は冬眠しますが、他の亀と同じように気温が15℃を下回ると冬眠に入ります。しかし気候によって冬眠する時期が異なり、一般的にわが国北方では10月に冬眠に入り、翌年の4~5月に冬眠を終える。しかし南方では11-12月に冬眠に入り、翌年の2-3月に冬眠を終えることができる。
具体的な冬眠期間はその土地の温度によって决められますが、一般的に気温が15℃を超えると回復していきます。コガメは冬眠を終えてすぐに餌を与えることはできず、完全に適合して環境に慣れてから餌を与える必要がある。冬眠を終えた後、飼育者はバクテリアに感染したり病気になったりしないよう、草亀の検査を受ける必要がある。
草亀は一般的に夏から大量の食物と脂肪を貯蔵して、飼育者は7-10月の時に多く彼らにいくつかの高タンパク、高脂肪の食物を与えることができます。気温が15℃を下回ると冬眠に入るため、飼育者は新しい容器を用意し、底に湿った砂を厚く敷き、その上に湿った新聞紙やタオルを敷き、少量の水を入れる必要がある。クサガメが冬眠する際、飼育者は光を避け、温度を0℃以上にし、タオルや新聞紙に水分を補給する必要がある。