魚が種を振るのを見つけたら、最初に網でシリンダーの底の魚の種をすくう。ペアで繁殖した魚の場合、種から幼魚が出ることがありますが、1匹で種を振ると水体を汚染するだけで水質が悪化するので、速やかに処理する必要があります。魚の種がシリンダーの底に付着しないようにするためには、種を振る前に偽の水草を置いたほうがいいです。魚の種が付着できるようにすると、掃除も便利です。
魚の種の最大の問題は水質を汚染することであり、水体の悪化が魚の健康に影響することを避けるため、定期的に水を交換することができる。注意しなければならないのは、魚は種を撒いた後に体が弱っているので、水を取り替える前に片飼いにしたほうがいいということです。この時は水を取り替えるのが頻繁で、毎回3分の1ぐらい交換しなければならないので、魚の体への刺激が大きく、気をつけないと母魚が死んでしまいます。
魚の種に対して、もう一つ簡単な掃除方法があります。魚が自分で食べるのを待つことですが、魚が食べるのは限られているので、貝を飼って、種を食べさせることができます。しかし、必ず早めに飼って、魚の種が出てから飼う準備をしなければなりません。サザエのほかにも、エビや底生魚を飼うことができ、卵を食べることもできます。
魚の種が水体に大きな汚染をもたらすことを防止するため、ブラシシリンダの時にそれを取り除くこともできる。水槽を磨く前に魚を一匹ですくって、水を全部捨てて、種を洗ってから、水を飼い直して、魚を戻します。この方法は面倒だが、母魚の生存を保証することができる。