人工藻除去は比較的簡単な方法で、柔らかい布を探して、藻が付着しているシリンダーの壁を直接拭いて、それを拭けばいい。注意しなければならないのは、生地が硬くなってはいけないことです。特にアクリル水槽を拭くと、跡が残って、観賞性に大きく影響します。人工的に藻を取り除くのは簡単だが、表面だけを取り除くことができ、環境を変えないと藻がすぐに生えてくる。
薬物による藻の除去は一定のリスクがあり、いったん用量をコントロールしないと、魚に危害を与えやすい。よく使われる藻除去薬には硫酸銅とグルタルアルデヒドがある。グルタルアルデヒドを例にとると、普段は水100リットルごとに2%濃度の溶液を5ミリリットル滴下すれば予防効果がある。もし藻が爆発したら、使用量を増やし、水40リットルごとに等量の薬を使う。
生物除藻は各種の藻類を食とする水生動物に頼って、例えば魚類の中のポケモン、青苔鼠など、エビ類の中の多くは藻類を食として、例えば大和沼エビ、極火エビなど、いくつかの貝、例えばアワビ貝、軍帽貝を飼うことができます。混養は必ずお互いに攻撃しないようにしなければならないことに注意しなければならない。
いかなる藻の除去方式もそれを完全に除去することを保証することができなくて、爆藻は環境がそれらの成長繁殖に適しているため、少し変えなければならない。例えば、水槽の受光時間を減らし、餌や肥料を減らすことで、成長速度を遅くすることができます。