濾材を直接かめに捨ててもいいですが、効果はフィルターボックスに入れたほうがいいほどではありません。ろ過システムは水を何重ものフィルターボックスを通過させてシリンダー内に戻すが、この過程でろ過の効率がより高くなるため、水質も維持しやすくなるからだ。しかし、シリンダー内に直接入れてしまうと、ろ過の効果を確保するのは難しい。また、フィルターボックスごとに異なるフィルター材を配置する必要があり、水質をより良く維持することができます。
1、ろ過綿：ろ過綿はろ過設備の中に不可欠な部分で、その作用は水の中に浮遊する粒子の不純物などをろ過槽内に残して、それによって水の体を清澄にすることです。注意点は、フィルター綿は長く使うと目詰まりする場合があるため、定期的に洗って交換すること。
2、バクテリアハウス：バクテリアハウスの役割はその名の通り、生物ろ過に欠かせない硝化細菌が付着する場所を提供することだ。水中の有機物は従属栄養菌によって分解されるが、アンモニア性窒素は魚に毒を与え、硝化細菌の役割はアンモニア性窒素を硝酸塩に変えることで魚の健康に影響を与えないようにすることだ。
3、活性炭：活性炭もよく見られる濾材の一種であり、水中の不純物を吸着し、水の状態を改善することができる。吸着量には上限があるので定期的に交換しないといっぱいになるので効果がないので注意が必要である。
