夜にポンプを開かないと、硝化細菌は死ぬので、全部死ぬわけではありませんが、シリンダー内の硝化システムはほぼ崩壊します。硝化細菌は水槽にとって特に重要な部分であり、それは主に二種類あり、第一は水の中のアンモニア性窒素を亜硝酸塩に変えることができ、第二は亜硝酸塩を硝酸塩に変えることができます。こうすれば、水中に魚の健康に有害な物質は存在しません。
1、ろ過:ポンプの主な役割はろ過です。これはシリンダー内の水を流れさせ、各フィルターボックスを通過してシリンダー内に吸い上げ、これで水のろ過が完了します。ろ過することで水質が維持され、流れて腐らないと言われるが、これは魚の健康にも大いに役立っている。
2、酸素充填:水槽ポンプは酸素充填の役割を果たすことができる。ポンプは作業中、空気の一部をシリンダー内に持ち込むことで、水の溶存酸素を高め、魚がより良い呼吸ができることを確保し、浮き頭などの症状の発生を避ける。
3、造流:一部のポンプは造流の機能を持っていて、このようにすることができてシリンダー内の水層の水流が均一で、死水区が現れない。それだけでなく、水中の污れがどこかに溜まるのを防いだり、ろ過に一役買ったりして、より水質を維持することができます。