水槽のポンプ自体が振動します。普通の場合、騒音は接続したタンクが共振しているためです。もしこの場合、管路がしっかり固定されていないことになります。解决するには簡単です。接着剤か何かで接着して、その振動幅が大きすぎないようにすればいいだけです。
ポンプが机の上に置かれている場合、それは作業時にも共振を引き起こす可能性があり、自分だけでなく、隣人にも影響を及ぼす可能性がありますので、下にマットを敷いたほうが共振を減らすことができますし、直接吊るすこともできますが、壁に掛けないでください。そうしないと、同じように騒音が発生します。
振動を減らすことで効果的に騒音を下げることができるほか、外部から遮断する方法もあります。密閉性の良い箱を作り、ポンプを外から包んで騒音を聞かないようにしたり、屋外に出してドアを閉めたりすることで、室内の騒音を下げることができます。
ポンプによっては、最初は騒音があまりなく、数年使っているうちに音がするものがありますが、これは主にローターの摩耗が激しいためです。この場合は適切な改造を行い、ケースを開けたら、新しいローターに交換すればいいので、面倒ならポンプをそのまま交換しましょう。