スッポンは水の中で呼吸することができませんが、それらはスッポンといっても、水の中で生活することができます。しかし魚とは大きな違いがあり、肺で呼吸をしており、しかも呼吸する器官は喉の部分にあるため、頭と首全体を水面に出して換気を行う必要があります。一般的にスッポンは1時間おきくらいに換気をしています。水に強いが、水位の高さにも注意しないと溺死する恐れがある。
スッポンは段階によって水位の高さが異なりますが、幼少期のスッポンは体が小さいので、養殖の際には、水位が深すぎないよう注意が必要で、20センチ以内がベストです。幼少期のスッポンは体力が弱く、適応力も劣るため、水位の高さも深すぎてはいけない。
成体になると、水位の高さは30~50cmに抑えられます。大人になってからのスッポンは体が大きく、体力も強くなるため、養殖の水位も適度に増やす必要がある。干し台が設置されていれば、水位ももう少し高くすることができます。しかし、定期的に水面に浮上して新鮮な空気を吸う必要があるため、水位の高さは60センチを超えないようにするのが望ましい。さもなくばスッポンのむせや溺死が起こるかもしれない。