錦鯉を飼う時、水質は1つの非常に重要な要素で、ずっと水質を維持する必要がある。しかし、水質が濁ることは避けられないことがあります。その際には、まず何が原因なのかを明らかにしてから、その原因に応じた措置をとることができます。具体的には、主に以下の3つの原因があります：
1、生物原因：ここでは水槽の中の水質汚染がいくつかの微生物によるものであるか、あるいはいくつかの緑色植物の大量繁殖によるものであることを意味します。この原因については、紫外線殺菌灯などの道具で対応した方が良いでしょう。
2、化学的原因：これは水槽の水質汚染がある薬物の添加によるものであることを意味する。例えば錦鯉が病気になったとき、水槽に薬の一部を投入したが、後期には掃除に注意しなかったため、汚染された。そのため，活性炭に吸着させることにより，水質を浄化することが望ましい。
3、物理的な原因：水槽の中に粒子状の物質が入って水質が濁っていることを意味します。例えば、餌を与えるときに投入した食べ物が多すぎて、魚が食べ終わっていないのに、養殖者がタイムリーに掃除していないので、汚染されています。その際、フィルターなどの道具を使って浄化することができます。
水槽の中で水質が濁っている場合は、硝化菌を入れて浄化できます。水質を常に優れた状態に保つためには，水槽の中のろ過循環システムが不可欠である。このシステムの中には硝化細菌を置くことができ，効果が高い。
