グッピーは、野外で育ったグッピーはすべて淡水に生息しているので、淡水魚に属する。また、原産地が淡水である地域では、水域中の塩分量が0.5%以下であることから、淡水魚である。飼育者が海水でグッピーを養殖しようとすると、死んでしまうこともある。
海水の塩濃度が高いため、グッピーの体内の塩濃度は低い。グッピーを海水に放置して成長させると、体内の水分がどんどん海に流れてしまい、脱水状態になって死んでしまうのです。人工養殖の場合は、水の塩の濃度を0.5%以内にするのが望ましい。
グッピーが最も好むのは弱アルカリ性の水質であり、飼育者はPH値を7.2-7.4の間に保つことができる。しかし適応できる水質の範囲は比較的広く、中性と弱アルカリ性の水中で生育し、飼育者がPH値を7.0−7.5に保っていれば正常に生育する。
グッピーの水質汚染は深刻ではなく、飼育者が水を交換する頻度もそれほど高くなくてもよい。フィルターがなければ、3~5日に1回水を入れ替え、1回の入れ替え量を総水量の3分の1に抑えればいい。フィルターが設置されていれば、5~7日に1回の水の入れ替えで済む。